專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。適用裝載肉類、水果等貨物。冷藏集裝箱造價較高，營運費用較高，使用中應注意冷凍裝置的技術狀態及箱內貨物所需的溫度 。
制冷集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不高于-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3d。
制冷集裝箱采用鍍鋅鋼結構，箱內壁、底板、頂板和門由金屬復合板、鋁板、不銹鋼板或聚酯制造。
國際上集裝箱尺寸和性能都已標準化。
使用溫度范圍為-30℃～12℃，更通用的范圍是-30～20℃
特點：制冷集裝箱具有裝卸靈活、貨物運輸溫度穩定，貨物污染、損失低，適用于多種運載工具，裝卸速度快，運輸時間短，運輸費用低。
按照運輸方式冷藏集裝箱可分為海運和陸運兩種。
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